Die Carl Zeiss Route beinhaltete insgesamt 17 Stationen und Orte, die eine Verbindung zu Carl Zeiss haben, und die am Carl Zeiss Tag in der Jenaer Innenstadt verschiedene Aktionen angeboten haben. Dazu gehörten unter anderem das Optische Museum, die Universität Jena und das Zeiss-Planetarium, sowie der Johannisfriedhof mit dem neu gestalteten Grab von Carl Zeiss.
Zentraler Punkt dieser Route war der Marktplatz, auf dem sich ZEISS als Hightech-Unternehmen präsentierte, unter anderem mit MINT-Mitmachangeboten für Kinder und junge Leute. Im Faulloch am Johannistor fanden junge Tüftler spannende Experimente. In der Goethe Galerie gab die Ausstellung des ZEISS Archivs einen Einblick in das Leben und Wirken von Carl Zeiss. Außerdem fanden die großen und kleinen Besucher hier Wissenschaft zum Anfassen, Interessantes zu Patenten aus Jena und vieles mehr.